Morimoto Leona e Otokawa Saori são novas na escola. Leona deseja subjugar todas as pessoas da escola, punindo aqueles que não tiverem uso pra ela, nem mesmo os professores (ou professoras) são excluídos disso. A série de sucesso Discipline é reavivada com esta nova história original definida antes da vinda de Hayami Takuro, protagonista da primeira série.